Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Snx20Q9D2Y5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Snx20Q9D2Y5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Snx20Q9D2Y5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms