Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmed11Q9D2R4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tmed11Q9D2R4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tmed11Q9D2R4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms