Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pramef12Q9D2F1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms