Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Snapc3Q9D2C9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms