Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Trappc6bQ9D289 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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