Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Spns3Q9D232 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Spns3Q9D232 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms