Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Mrpl28Q9D1B9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl28Q9D1B9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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