Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Syf2Q9D198 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms