Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmem53Q9D0Z3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms