Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisa9Q9CZN4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms