Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cops7aQ9CZ04 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cops7aQ9CZ04 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cops7aQ9CZ04 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cops7aQ9CZ04 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Cops7aQ9CZ04 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Cops7aQ9CZ04 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Cops7aQ9CZ04 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cops7aQ9CZ04 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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