Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rpl11Q9CXW4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms