Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SdhdQ9CXV1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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