Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nip7Q9CXK8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nip7Q9CXK8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nip7Q9CXK8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nip7Q9CXK8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nip7Q9CXK8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nip7Q9CXK8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Nip7Q9CXK8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Nip7Q9CXK8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Nip7Q9CXK8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Nip7Q9CXK8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nip7Q9CXK8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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