Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rpusd4Q9CWX4 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms