Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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