Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pfdn1Q9CWM4 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Pfdn1Q9CWM4 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pfdn1Q9CWM4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pfdn1Q9CWM4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pfdn1Q9CWM4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pfdn1Q9CWM4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pfdn1Q9CWM4 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pfdn1Q9CWM4 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pfdn1Q9CWM4 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Pfdn1Q9CWM4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pfdn1Q9CWM4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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