Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NubplQ9CWD8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms