Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ykt6Q9CQW1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.6 ms