Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
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Nicn1Q9CQM0 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Nicn1Q9CQM0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms