Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rwdd1Q9CQK7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms