Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Use1Q9CQ56 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Use1Q9CQ56 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Use1Q9CQ56 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Use1Q9CQ56 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Use1Q9CQ56 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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Use1Q9CQ56 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Use1Q9CQ56 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Use1Q9CQ56 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Use1Q9CQ56 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Use1Q9CQ56 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Use1Q9CQ56 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms