Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Efcab2Q9CQ46 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Efcab2Q9CQ46 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms