Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1b4Q99ME6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms