Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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