Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ctu1Q99J10 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms