Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccdc115Q8VE99 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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