Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Smg8Q8VE18 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Smg8Q8VE18 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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