Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Slc6a20aQ8VDB9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms