Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8R3C1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8R3C1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms