Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hecw1Q8K4P8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hecw1Q8K4P8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms