Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Vrk3Q8K3G5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Vrk3Q8K3G5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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