Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Lrrtm1Q8K377 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Lrrtm1Q8K377 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 288.9 ms