Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Trappc12Q8K2L8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc12Q8K2L8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms