Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Abcf3Q8K268 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Abcf3Q8K268 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Abcf3Q8K268 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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