Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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