Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Csnka2ipQ8CH19 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Csnka2ipQ8CH19 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Csnka2ipQ8CH19 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnka2ipQ8CH19 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnka2ipQ8CH19 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnka2ipQ8CH19 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnka2ipQ8CH19 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Csnka2ipQ8CH19 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Csnka2ipQ8CH19 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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