Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Slc43a2Q8CGA3 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms