Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4aQ8C9S8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Atg4aQ8C9S8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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