Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q8C5C9 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms