Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TtpaQ8BWP5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TtpaQ8BWP5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms