Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms