Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nop53Q8BK35 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms