Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Slc5a7Q8BGY9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Slc5a7Q8BGY9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Slc5a7Q8BGY9 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Slc5a7Q8BGY9 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Slc5a7Q8BGY9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Slc5a7Q8BGY9 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Slc5a7Q8BGY9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Slc5a7Q8BGY9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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