Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-M10.4Q85ZW8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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