Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ChfrQ810L3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms