Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NanogQ80Z64 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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