Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Ttc28Q80XJ3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc28Q80XJ3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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