Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pcsk9Q80W65 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pcsk9Q80W65 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 359.4 ms