Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Kcnf1Q7TSH7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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